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各部會爭取百億元科技預算，依遊戲規則，各部會提案主要有三大類型，包括與產業合作的旗艦產業領航、科技創新及前瞻基礎研究。愈能揚名國際或帶動發展龍頭企業者，愈容易爭取到科技預算經費。
根據行政院科技會報辦公室、科技部訂定的遊戲規則，各部會爭取百億元經費的提案內容，主要有三大類。
第一，旗艦產業領航類，強調與產業界的合作，並能發展出龍頭企業。
第二，科技創新生態體系發展類，透過產學研連結，以居家照護床創新為目標，投入研發及產業發展。透過產學研合作，才能發揮科技學術最大能量。
第三，前膽基礎研究及人才培育類，以五大創新產業研發為例，希望提出更好花蓮電動床前膽基礎研究，才能產業化，要有國際級系統開發，例如生技醫藥開發，癌症精準醫療的投入等。
據了解，目前各部會提出的提案，在這三類的分布相當平均，各約有八、九億元的預算經費需求，計畫項目約一、二十項左右，提案數量較多的是第二類，有廿項以上。
對科技預算執行成效的衡量，過去在ＫＰＩ上，各部習慣會列出執行方式，例如舉辦過幾場媒合會議等，未來ＫＰＩ要強調的是，最終產出結果是什麼，例如有十項新產品在國際市場上市、或帶動多少產值等，要有更具體的效益指標。
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